试验研究 | 沙地云杉PmSYP81基因克隆与表达分析
试验研究 | 沙地云杉PmSYP81基因克隆与表达分析
摘要 为探究沙地云杉PmSYP81基因的分子结构特征及其在不同组织中的相对表达量,以沙地云杉(Piceamongolica)为材料,通过提取总核糖核酸(RNA),利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术扩增得到PmS-YP81基因的互补脱氧核糖核酸(cDNA)序列,将该序列克隆至
载体,经测序验证后,对其进行生物信息学分析,包括氨基酸序列推导、蛋白质理化性质分析、二级和三级结构预测以及同源性比对等。结果显示: PmS- (2YP81基因的全长为 942bp ,编码314个氨基酸。该蛋白具有1个N端结构域和1个可溶性N一乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体(soluble N-eEthylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor,SNARE)超家族结构域,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、向日葵(Helianthus annuus)和紫金舌唇兰(Platanthera zijinensis)等7种植物具有较高的同源性。 PmSYP81 蛋白存在一个跨膜结构,属于亲水性蛋白,丝氨酸和苏氨酸位点比例较高。成功克隆了 PmSYP81 基因,并对其进行了多方面分析,为深入研究该基因在沙地云杉中的生物学功能奠定了基础。